То, что сегодня известно о структуре и эволюции Тянь-Шаня, является результатом систематических исследований кыргызских, российских, казахстанских ученых и ученых других зарубежных стран. В последние годы исследованием данного региона наряду с Республиками Центральной Азии и Россией занимаются ученые США, Германии, Франции, Бельгии, Китая и других стран, представляющие различные научно-исследовательские организации. Примером эффективного научного сотрудничества явилось выполнение международного мультидисциплинарного проекта "Геодинамика Тянь-Шаня". К настоящему времени Научная станция имеет самые тесные научно-технические контакты и проводит совместные исследования со следующими организациями:
- Институт геологии Национальной академии наук Кыргызской Республики
- Институт сейсмологии Национальной академии наук Кыргызской Республики
- Институт физики и механики горных пород НАН Кыргызской Республики
- Кыргызско-Российский Славянский университет имени Б.Н. Ельцина
- Кыргызский национальный университет им. Ж. Баласагына
- Американский университет в Центральной Азии
- Агентство по геологии при Правительстве Кыргызской Республики
- Геологический институт Российской академии наук
- Институт океанологии Российской академии наук
- Московский государственный университет
- Объединенный институт высоких температур Российской академии наук
- Объединенный Институт геологии, геофизики и минерального сырья Сибирского отделения Российской академии наук
- Сейсмологическое бюро СУАР, Китай
- Институт геоэкологии Российской академии наук
- Объединенный институт физики Земли им.О.Ю.Шмидта Российской академии наук
- Институт сейсмологии МОНиК Республики Казахстан
- Институт геофизики национального ядерного центра республики Казахстан
- Национальный университет Узбекистана им. Улугбека
- Институт сейсмологии Узбекистана
- НПК "Прогноз" Казселезащита, Агенство по чрезвычайным ситуациям республики Казахстан
- Университет штата Орегон, США
- Индианский университет, США
- Массачусеттский технологический институт, США
- Центральный Вашингтонский университет, США
- Институт планетарной геофизики и океанографии Калифорнийского университета в Сан Диего, США
- Калифорнийский университет в Риверсайде, США
- Мюнхенский университет, Германия
- Потсдамский университет, Германия
- Компания "Phoenix Geophysics", Канада
- Государственный университет Сан-Диего, США
- Калифорнийский университет Сан-Диего, США
- Корпорация сейсмологов университетов США (IRIS)